
細胞間の不均一性は、幹細胞の分化、発達、癌、医薬品の有効性および免疫応答を含む様々な細胞プロセスで観察される一般的な現象である。 フローサイトメトリーや免疫細胞化学などの単一細胞の行動を研究する伝統的な方法は、しばしばあいまいな結果をもたらし、複雑な細胞集団内のユニークで多様な行動を強調することができない。 最近、UCバークレーの科学者は、細胞間の不均一性を測定することができる新しい単一細胞ウェスタンブロット(scWestern)法を開発しました。 この方法は、抗体プロービングの前にタンパク質分離ステップに部分的に起因して、オンターゲットとオフターゲット信号間のより良い識別を可能にする。
scWestern Protocol
シングルセルWestern分析は、6,720マイクロウェルの配列でマイクロパターン化された薄い光活性ポリアクリルアミド(PA)ゲルでコーティングされた顕微鏡スラ

上記のプロトコルを利用して、科学者たちは、単一のニューロン幹細胞内のMAPKシグナリングダイナミクスを研究しました。 リン酸化ERK1/2(pERK)をプロービングすると、異なるサイズの二つのタンパク質が検出されました。 Perk5であると推定されるより大きなタンパク質は、配列相同性のためにperk1/2抗体と交差反応することが報告されている。 ScWesternブロッティング法は、科学者がこの余分なタンパク質バンドは、(1)実質的な細胞間変動がperk5バンドのために存在し、(2)pERKとERK抗体蛍光シグナルは相関しなかったので、オフターゲット抗体プロービングによるものであったと仮定することを可能にした。 従来のICCおよびFCの試金は頻繁に試金の特定性を進め、いろいろな刺激への多様な細胞応答を強調するためにscWesternのしみを強力な方法をする誤ったタ
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Hughes et al. (2014年)。 シングルセルウェスタンブロッティング。自然の方法。11(7), 749-755. |
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