tämä lähestymistapa paljasti uusia tapoja kohdentaa soluja, jotka kuljettavat mutaatioita syöpää aiheuttavissa geeneissä. Esimerkiksi tutkijat osoittivat herkkyyttä FDA: n hyväksymälle lääkkeelle, palbociklibille, keuhkosyöpäsoluissa yleisesti mutatoituvalle geenille, jota nyt testataan kliinisessä tutkimuksessa.
tulokset julkaistaan verkossa Nature Communications-lehdessä.
monilla syöpäsolujen kasvua edistävillä geeneillä ei ole lääkkeitä niitä vastaan. ”Tuumorisuppressori” – geenien osalta tutkijat eivät useinkaan ole varmoja, miten mennä niiden perään. Kun kasvaimen vaimentajat ovat poissa, solut usein häiriintyvät, mutta ei ole Napakymppi jäljellä kohde. Syöpäsolujen häiriintymisen hyödyntäminen on edelleen pelottava haaste, sanoo vanhempi kirjailija, filosofian tohtori Haian Fu.
”lähestymistapamme on sijoittaa tuumorinvaimentimet syöpään liittyvien proteiinien verkoston yhteyteen ja liittää kasvainvaimentimet lääkkeisiin tunnetun lääkkeen kohdeproteiinin kautta”, Fu sanoo. ”Näin tuumorisuppressorin muutokset voivat liittyä kohteen vasteeseen kytkettyyn lääkkeeseen.”
tutkimus on osa kansallisen syöpäinstituutin Cancer Target Discovery and Development (CTD2) – verkoston ponnistusta kääntää genomitietoa terapeuttisiksi strategioiksi, hän sanoo. Emory on NCI CTD2-verkoston jäsen.
Fu omistaa Winship Partner in Research endified Chairin ja on Winship ’ s Discovery and Developmental Therapeutics Programin johtaja, Emory Chemical Biology Discovery Centerin johtaja sekä farmakologian ja hematologian ja lääketieteellisen onkologian professori. Vastaava kirjailija FADLO Khuri, MD, ylläpitää professorinimitystään Winship Cancer Institutessa ja on nyt Beirutin amerikkalaisen yliopiston presidentti Libanonissa.
Syöpätutkijat ovat etsineet keinoja kohdentaa mutaatioita geenissä STK11 / LKB1, jota esiintyy 15-25 prosentissa ei-pienisoluisista keuhkosyövistä. Tuumorisuppressori STK11 / LKB11 koodaa entsyymiä, jonka uskotaan säätelevän solujen siirtymistä ja aineenvaihduntaa.
yksi Winship-ryhmän vasta havaituista vuorovaikutuksista — hämähäkin seitin” säie ” — viittasi siihen, että äskettäin metastasoitunutta rintasyöpää vastaan hyväksytty palbociklib saattaa toimia lkb1: ssä mutaatioita kantavia soluja vastaan lkb1: n yhteyden kautta CDK4: ään, palbociklibin kohteeseen.
tätä ennustetta tukivat genomitiedon analysointi ja soluviljelmäkokeet: keuhkosyöpäsoluissa, joissa oli LKB1-vikoja, oli taipumus lisätä herkkyyttä palbociklibille. Nyt Winshipin toimitusjohtaja Taofeek Owonikokon johtamassa tutkimuksessa käytetään lkb1-statusta biomarkkerina palbociklibin vaikutuksen tulkinnassa.
miten oncoppi vaikuttaa
jos solut ovat monimutkaisia koneita, on olemassa useita tapoja selvittää, miten koneiden osat, joita hallitsevat proteiinit, sopivat yhteen. Jotkut niistä sisältävät useita pesuvaiheita epäspesifisten kumppaneiden poistamiseksi solujen hajottamisen jälkeen, mutta tuskailla (Förster resonance energy transfer) ei. Jos kaksi fluoresoivaa molekyyliä, joiden värit ovat lähellä spektriä, ovat riittävän lähellä (alle 10 nanometriä), tuo läheisyys voidaan havaita fretillä.
Fu ja hänen kollegansa perustivat laajan alustan, jolla voitiin merkitä proteiineja kahdella eri fluoresoivalla molekyylillä, tuoda ne syöpäsoluihin ja sitten havaita proteiinien väliset vuorovaikutukset. He kutsuvat tätä syöpään liittyvien proteiinien verkostoa ” Oncoppiksi.”
ryhmä havaitsi 83 keuhkosyöpään liittyvän proteiinin joukon alussa yli 260 yhteisvaikutusta, joita ei aiemmin tunnettu. He testasivat yhteisvaikutuksia useita kertoja, eri suuntauksissa, ja muissa keuhkosyöpäsolulinjoissa valikoiduilla yhteisvaikutuksilla luotettavuuden varmistamiseksi. Yli 80 prosenttia tutkijoiden havaitsemista vuorovaikutuksista voidaan vahvistaa toisella menetelmällä (GST pulldown).
lisäesimerkkinä valkuaisaineverkkojen hyödyllisyydestä ryhmä keskittyi merkittävään Onkoproteiini Myc: hen, jota pidettiin myös ”undruggable.”Mutta tutkijat voisivat yhdistää Myc: n epäsuorasti NSD3: n kautta toiseen proteiiniin nimeltä Brd4, jota vastaan on kehitetty inhibiittoreita. Brd4-estäjiä testataan parhaillaan kliinisissä tutkimuksissa. Tämä löydös paljasti uuden polun Brd4-NSD3-Myc mahdollisina kohteena terapeuttisille toimenpiteille, Fu sanoo.